石莲洞在万华山南麓，座西北朝东南。东西长150米，南北长140米，占地21000平方米。内有大小洞八、九处。主洞名“佛庐”，高11米，占地300平方米，可容百余人憩息。崖壁纹形黝黑，呈人物鸟兽诸状，天然趣成，栩栩如生。“佛庐”右后有副洞，高8米，若厅堂，若厢房。再后是若干小洞，洞洞相连，纵横交错如迷宫，要猫腰侧身方可出入。小洞内，石钟乳横插倒竖，状如山川人物，花木鸟兽。阳光从罅隙中透人，仿佛万千金丝线从天上垂落人间。

    主洞上方有石桌、石墩、石床，相传是罗洪先当年著书立说、休息之所。他在这里勤奋求索，发明了比例尺，绘制出我国历史上最早的分省地图集《广舆图》。出主洞往左百余米处有短垣，垣上有小门，罗洪先手书的题额“虎豹关”笔力遒隽。相传这里是罗洪先当年驱除虎豹之地。虎豹关后面不远的岩壁上，有罗洪先手书“梅关”二字。当年罗洪先见这里梅花朵朵，铁骨铮铮，诗兴大发，作《四月至洞见梅花》诗一首，诗曰：“春日初临已艳阳，石门自启入青苍。莫言洞里无供给，已因梅花到骨香。”兴之所至，又在洞壁题“梅关”为记。壁间还刻有万历进士罗大缭()统怀念罗洪先的五绝一首：“洞主乘龙去，何日重返槎?岩头明月在，常照石莲华”。

    佛庐洞还筑有“讲经台”，是罗洪先讲学的地方。相传罗洪先通《易经》，他精选弟子，筑台讲授《易经》。讲经台重檐丹楹，四周古木簇拥；壁间有一副楹联：“讲席至今存大雅，经台终古壮奇关”。罗洪先早已归去，斗转星移，讲经台更名为“小蓬莱”。

    石莲洞的岩石中长着古荆树，有一株高达数丈，繁枝密叶；主洞门右侧，有数株罗汉松，树干3人搂抱不过，枝丫虬曲盘旋，苍翠蓊郁；高大的古柏，经数百年风霜，翠绿依旧。古荆、罗汉松、古柏，都为罗洪先亲手栽植。

    洞前有怀濂堂，是罗洪先为怀念大理学家周濂溪而建筑的。洞南有正学书院，为明嘉靖三十七年(1558)督学王敬所创，罗洪先作记。书院规模较大，青砖碧瓦，前后两栋，中有天井。前栋曰“正学堂”，后栋曰“观复阁”。正学堂左为“六秀堂”，右为“归静处”。门前两侧有厢旁，左叫“探月轩”，右称“远尘楼”，志载，罗洪先曾在此攻读著述，会友授徒。

    1958年，在“正学堂”创办了石莲农业中学，后改为石莲中学。